Христианство было запрещено в Японии в период с середины 17 века до середины 19 века. Этот период принято называть временем Христианских преследований в Японии. Эпоха преследований христиан в Японии началась после издания эдикта “Запрещение христианства” (known as the “Bateren-tsuiho-rei”) в 1614 году Токугава Иэясу, первым шогуном Токугава. Этот указ был усилением предшествующего запрещения религии, введённого им в 1612 году.
Преследование христиан в Японии привело к тому, что верующие были вынуждены скрывать свои верования или практиковать их в тайне. Христианские миссионеры, иностранные купцы и японские христиане подвергались жестоким мучениям и казням за свою веру. Хотя существовали периоды относительного умеренства в преследованиях, запрещение христианства оставалось в силе до середины 19 века.
Эти преследования оказали значительное влияние на развитие христианства в Японии. Многие христиане стали практиковать свою веру в потаенности, что привело к формированию особой культуры христианского подполья в Японии. После отмены запрещения христианства в середине 19 века приверженцы этой веры смогли открыто исповедовать свою религию и вновь начать строить церкви и общины по всей стране.