Древней столицей Японии был город Нара. В 710 году по н. э. он стал первой крупной столицей Японии и просуществовал в этом статусе до 794 года. В этот период Нара носила название Хэидзё-кио (столица Мирного Света). После переноса столицы в 794 году, на следующие несколько столетий она была распределена между городами Киото, Осака и Камакура. Киото стал столицей Японии c 794 по 1868 годы и остается важным культурным и историческим центром страны до сегодняшнего дня.
Токио, или как его прежнее название Эдо, стал столицей Японии в 1868 году в период Мэйдзи. В 1869 году император Мэйдзи перенес свою резиденцию из Киото в Эдо, переименовав его в Токио, что означает “Восточная столица”. Токио остается столицей Японии и сегодня, являясь крупнейшим городом страны и важным политическим и экономическим центром.
Хиросима, хотя и является одним из известных городов Японии, никогда не была столицей страны. Она, тем не менее, привлекла мировое внимание в результате атомного бомбардирования 6 августа 1945 года.